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脫乙酰度（degree of deacetylation，DD）是脫去乙酰基的葡萄糖胺單元數占總的葡萄糖胺單元數的比例，它是考察甲殼素/殼聚糖最基本的結構參數之一。脫乙酰度對殼聚糖的溶解性能、黏度、離子交換能力以及絮凝性能等都有重大影響。通常，脫去55%以上N乙酰基的甲殼素能溶于1%乙酸或鹽酸，被稱為殼聚糖，但脫乙酰度在70%以上的殼聚糖才能作為有使用價值的工業品。脫乙酰度在55%-70%、70%-85%、85%-95%、95% -的殼聚糖分別稱為低脫乙酰度殼聚糖、中脫乙酰度殼聚糖、高脫乙酰度殼聚糖、超高脫乙酰度殼聚糖，極難制備脫乙酰度為的殼聚糖。

殼聚糖在水、乙醇和丙酮中不溶解，在無機酸和酒石酸、水楊酸、抗壞血酸等有機酸及許多稀酸溶液中能溶解。殼聚糖分子中的-NH2，基團在酸性環境中會被質子化形成 NH3+離子，從而在酸性條件下會溶解。而甲殼素的N-乙酰基不能質子化所以無溶解性，可見殼聚糖的脫乙酰化度與溶解性關系密切。脫乙酰化度在50%以下、60%-80%、80%以上的殼聚糖溶解狀態分別為部分離析溶解于稀醋酸溶液中、呈絮凝態懸浮于稀醋酸溶液中、以油狀清澈地溶于稀醋酸溶液中，脫乙酰度在50%以下的，肯定不溶于濃度1%的稀酸。由此可見，甲殼素與殼聚糖的差別，僅僅是脫乙酰度不同而已。制備高脫乙酰度的殼聚糖在開發殼聚糖產品過程中非常重要，因為脫乙酰度可以決定甲殼素的溶解性，也是對其進行化學修飾功能化改性的前提條件。通常使用的高脫乙酰度中低相對分子質量、低黏度的殼聚糖都需要將廠家商品進一步水解、降解處理。