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γ射線照射下輻射降解：輻射降解是在放射性射線照射下， 使殼聚糖分子產生電離或激發的物理效應，進而導致分子鏈斷裂。

光降解法：紫外線、可見光和紅外線對殼聚糖的輻照也可以降解殼聚糖， 當輻照的波長小于360nm時降解反應較明顯。

酶降解法：酶降解法與其它降解方法相比，具有反應條件溫和，降解過程及降解產物相對分子量分布容易控制， 制備的低聚殼聚糖生物活性高，產物不用除鹽，過程容易控制，且不對環境造成污染等優勢，是理想的降解方法。

糖基轉移法：糖基轉移法是建立在酶反應基礎上的，利用低聚合度寡糖在酶參與作用下，延長糖鏈成為高聚合度寡糖。

復合降解法：單一降解法各具優勢，但又存在各種問題。復合降解法的出現使低聚殼聚糖的制備進入了一個新的階段，它是通過對各種單一降解法優缺點分析后進行優化組合，或引入較新的分離技術以實現工業化生產。