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在幾種重要的代謝反應中起作用。在二羧酸的異構作用中，例如在谷氨酸轉化為甲基天冬氨酸的酶促反應中，在乙二醇和甘油轉化為醛類，生物合成甲基基團以及核苷的合成中需要輔酶B12

其他重要輔酶　除了 B族維生素成員組成了大部分重要的輔酶以外，在生物化學上重要的還有輔酶Q、谷胱苷肽、尿苷二磷酸葡糖(UDPG)、維生素K族等。

其他重要的輔酶

1、輔酶Q(CoQ)　輔酶 Q是生物體內廣為分布的一類醌類物質，又稱為泛醌。存在于線粒體內膜中，是生物氧化呼吸鏈中的一個不可缺少的氫遞體，具有重要的生理意義。輔酶 Q側鏈的異戊二烯單位的長度對于不同的生物種可以是不同的。

2、谷胱甘肽(Glutathion)　谷胱甘肽是一個小分子量的胞內三肽，即γ-L-谷氨酰-L-半胱氨酰甘氨酸在大多數生物細胞中，谷胱甘肽的主要作用是保護一些蛋白質的巰基以維持它們在還原狀態。