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谷氨酰胺轉胺酶的開發應用，給原有意義上的酶法改性蛋白帶來了一次意義深遠的革命。正常酶法改性蛋白通常采用水解酶作用于一定的肽鍵，將大分子的蛋白質降解為具有一定功能的小分子肽段，即僅僅局限于蛋白質的水解作用。而谷氨酰胺轉胺酶則通過分子插入、交聯反應、脫氨作用，使蛋白質分子結構發生變化。

谷氨酰胺轉胺酶在食品中具有多種用途，主要包括:

改善食品質構。谷氨酰胺轉胺酶可以催化蛋白質分子間發生交聯反應、改善蛋白質的許多重要性能。如用該酶生產重組肉時，不僅可以將碎肉粘結在一起，還可以將各種非肉蛋白交聯到肉蛋白上，可肉制品的口感、風味、組織結構和營養。

提升蛋白質的營養價值。谷氨酰胺轉胺酶可以將人體氨基酸（如賴氨酸）共價交聯到蛋白質上，可防止美拉德反應對氨基酸的破壞；可提高蛋白質的營養價值。谷氨酰胺轉胺酶還可以向氨基酸組成不理想的蛋白質中引入所缺氨基酸，增強其營養性。