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在中樞，尤其是在脊椎里，甘氨酸是一個抑制性神經遞質。假如甘氨酸接受器被激活，氯離子通過離子接受器進入導致抑制性突觸后電位。是這些離子接受器的拮抗物。在鼠體內其LD50指標為0.96毫克/千克體重，死因是超興奮性。在中樞中甘氨酸與谷氨酸同是激動劑。甘氨酸以往一直被認為是除了GABA以外最重要的抑制性神經遞質。甘氨酸在CNS中有廣泛的分布,在神經信號的傳遞以及參與各種生理和病理反應中起著的重要基礎作用。

食品

用作生化試劑，用于醫藥、飼料和食品添加劑，氮肥工業用作無毒脫碳劑；

營養增補劑。主要用于調味等方面；

對枯草桿菌及大腸桿菌的繁殖有一定。故可用作魚糜制品、花生醬等的防腐劑，添加量1%～2%；

抗氧化作用（利用其金屬螯合作用）添加于奶油、干酪、人造奶油可延長保存期3～4倍；

為使焙烤食品中的豬油穩定，可添加葡萄糖2.5%和甘氨酸0.5%；

速煮面用的小麥粉中添加0.1%～0.5%，同時可起調味作用